• Les logiciels de calcul scientifique

• • maple (version 12 : exécutable maple ou xmaple, version 14 : exécutable maple14 ou xmaple14)
  • matlab (version R2010b, exécutable matlab)
  • pari (version 2.5.0, exécutable gp)
  • scilab (version 5.3, exécutable scilab)

ainsi que les logiciels de post-traitement graphique

• • paraview (version 3.10.1, exécutable paraview)
  • tecplot (version 11.2-0-563, exécutable tec360)
  • visit (version 2.2.0, exécutable visit)
  • xmgrace (version 5.1, exécutable xmgrace)

sont accessibles depuis votre poste de bureau et la machine servisu qui est essentiellement destinée au post-traitement (ssh -Y servisu).

• Lorsque vous n’utilisez pas d’interface graphique, nous vous recommandons de lancer matlab, scilab et maple avec les commandes :
  • nohup echo « exec (’file.sci’) ; quit » | time scilab -nw > print.res &
  • nohup time matlab -nojvm -nodisplay

    <IMG//>

print.res &

• • nohup time maple

    <IMG//>

print.res &

• Ces logiciels sont également disponibles sur les machines de la plateforme PlaFRIM :

• • sur les machines devel0n, n=2,...,8 pour du calcul et post-traitement en mode interactif via une connexion ssh ou ssh -Y (si vous utilisez une interface graphique) sur ces machines. Ils y apparaissent sous la forme de modules dans une partition nommée /opt/cluster/softs/modulefiles. Il faut charger le module correspondant afin de les utiliser ;

• • les modules matlab/R2010b, scilab/5.3.2, maple/12 et maple/14 sont également disponibles sur le cluster de calcul bonobo pour la soumission des calculs en mode batch ;

• • le logiciel magma (version 2.17.12) est disponible uniquement sur la machine dancharia , les machines devel0n, n=2,...,8, et toutes les machines du cluster bonobo. Le module correspondant se nomme magma/2.17.12 dans la partition /opt/cluster/plafrim-dev/modulefiles ;

• • le logiciel xmgrace n’est pas un module et il est accessible sur l’ensemble des machines interactives dancharia et devel0n n=2,...8 via une connexion ssh -Y sur ces machines.

• Pour le post-traitement de vos données qui se trouvent sur la plateforme de calcul PlaFRIM, si vous ne souhaitez pas les transférez sur votre compte imb via la commande scp (scp -r identifiant@mygale:chemin/repertoire-donnees .), il est fortement recommandé de les visualiser directement sur votre poste de bureau en accédant à ces données à distance via une procédure sshfs.

-** Il n’est pas recommandé d’utiliser ces logiciels qui fonctionnent avec une interface graphique directement sur les machines devel0n pour des raisons de lenteur ou de problème d’affichage sur votre poste de bureau car les machines devel0n ne possèdent pas des cartes graphiques puissantes.

-** Ces logiciels quand il s’agit de faire du post-traitement sont installés sur ces machines uniquement comme palliatif à l’impossibilité d’un usage local via sshfs ou pour exploiter les moteurs de traitement sur des petits cas tests et non pas l’affichage graphique.